Banyak jenis kanker yang dapat menyerang manusia, namun karena keterbatasan dana, sarana dan sumber daya manusia, maka untuk menjalankan program agar berhasil guna dan berdaya guna, saat ini ada 10 jenis kanker yang menjadi prioritas utama Yayasan Kanker Indonesia.

Prioritas YKI saat ini:

• Kanker leher rahim
• Kanker payudara
• Kanker hati
• Kanker paru
• Kanker kulit
• Kanker nasofaring
• Kanker kolorektal
• Leukemia Trofoblas ganas
• Limfoma maligna

Guna mendukung program-programnya, Yayasan Kanker Indonesia memliki struktur organisasi yang bekerja secara terpadu dan berkesinambungan, meliputi

a. Bidang Pendidikan dan Latihan Profesi
b. Bdang Penelitian dan Registrasi Kanker
c. Bidang Pelayanan dan Rehabilitasi
d. Bidang Penyuluhan dan Penerangan Masyarakat
e. Bidang Organisasi dan Pembinaan Wilayah
f. Bidang Dana
g. Unit Penanggulangan Masalah Merokok
h. Unit Hubungan Luar Negeri